2019?6个创始成员共同组成了全球生物铸造联盟(GBA),到目前为止,已经发展?5个成员,其中国内成员?个。这些Biofoundry的建立,以其先进的、满足高通量生物工程项目和早期规模化需求的设施,为新兴生物经济加速发现提供十分强大的支撑、/p>
全球生物铸造联盟地国/p>
Q 为了实现以最快速度将更好更便宜的成果或产品推向市场的目的,如何搭建Biofoundry呢?
A 从最初的设计出发,主要需要三个步骤:确定所需功能、分析可能性(文库、底盘生物)、明确过程(进化筛选、编辑)。在此,通过公开资料,小贝整理了若干Biofoundry的自动化平台设施,一起来看看他们是如何通过高通量自动化系统实现合成生物学流程开发的吧、/p>
位于伦敦帝国理工学院的London Biofoundry是新GBA的主要创始成员之一,具有非常全面且顶尖的生物合成平台:SYNTAX DNA printer用于in-house oligo合成,超高通量声波移液系统Echo 525?50用于药筛、自动化克隆涂布、无细胞合成、酶促试验等,整合了Echo 550的Access平台用于整合系统工作流,深度整合了Echo、Clariostar和Liconic培养箱的Biomek i7平台,DNA和RNA样品分析系统,克隆挑选系统,测序平台,流式细胞仪,微型生物反应器,AKTA蛋白纯化系统,HPLC和LC-MS平台,共聚焦活细胞成像系统等、/p>
作为微生物免疫治疗的先驱,总部位于伦敦的生物技术公司Prokarium与London Biofoundry合作,并利用其尖端技术平台高效实现定向进化和菌种基因改造等工作流;成立?019年的Multus利用London Biofoundry蛋白工程和基于生物反应器的生产和复杂分析解决方案(HPLP和LC-MS)平台为养殖肉类行业开发环境可持续和符合伦理的培养基,和低成本可扩展的胎牛血清替代品、/p>
London Biofondry Capabilities
加拿大温哥华的Biofactorial高通量设施位于不列颠哥伦比亚大学生命科学研究所,该设施可以访问一个大型宏基因组样本和化合物库,这些资源可供客户使用,以帮助探索新的蛋白质、生物传感器或化合物的药物发现。可以说无Echo不Foundry,这一高通量设施的核心设备也 Access工作站,整合有Echo,Pherastar酶标仪,细胞培养箱(CO2和O2控制)等设备;同时也配备有QPix Colony Picker高通量设备,实现高通量菌株构建和筛选。此外还配备了Biomek3000等液体处理工作站和分液器,可用于哺乳动物细胞培养,测序准备和其他应用、/p>
加拿大温哥华Biofactorial的核心Access系统
日本神户大学工程生物研究中心的Biofoundry研究小组正在通过整合计算机技术来设计代谢途径、酶选择和基因序列设计,建立一个结合数字、生物技术和机器人技术的平台。该平台还将用于高通量DNA合成/基因工程/基因组编辑技术、合成生物学技术和先进的计量技?包括代谢组分?、/p>
Professor HASUNUMA介绍日本神户大学整合研究中心实验室Biofoundry系统
位于澳大利亚布里斯班的CSIRO Biofoundry同样拥有全套专业设备,能够满足合成生物学和相关领域大批量项目的需求。除了基础移液流程外,更多高通量设备使其可执行从DNA组装到表型分析的完整的工作流程、/p>
中科院天津工业生物技术研究所目前也搭建了从菌种保藏、多底盘微生物菌种改造、蛋白纯化、超高通量秒级尺度的质谱前处理与分析系统全流程自动化大设施。在大范围模式生物体中已经实现了自动化基因操作,在一些模式生物体中已经实现了每天400次的高通量自动化基因组编辑。整体通量预估可实现每 100?00 次(单基因克隆)每天100 次(复杂质粒多模块组装),并保持>90%的高成功率、/p>
最后,我们一同参观欧洲最大的合成生物学Biofoundry,看自动化、智能化平台如何加速乐斯福研究,为营养、健康和环境提供可持续和天然的解决方案、/p>
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