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已认?/p>
Pooling是测序文库上机前的临门一脚。经过数小时乃至几天的实验,初始样品终于变成浓度、片段大小都符合质控指标的library嗷嗷待测。Pooling实验通常由两位操作者协作。根据表单信息将文库归一化到一定浓度,再将想要合并测序的文库混合,耗时耗力、/span>
事实上Pooling完全可以不需要密集的吸液移液操作,不需要这么多时间和精力投入,甚至就不需要移液器和吸头。采用Echo声波移液系统?2分钟即可完成384个文库pooling1,而手工完成归一化和pooling需耗时长达3小时、/span>
Echo通过聚焦声波能量转移低至2.5nL的样品,不需要吸头,无物理接触。每秒传输几百个液滴实现nL到uL级的液体传输。Echo可以微量化反应体系到几微升,甚至数百纳升,将样品从微孔板任意孔快速转移到目的板任意孔。在基因组学及合成生物学中,被应用到微量化NGS建库和快速pooling文库、引物、寡聚核苷酸探针当中、/span>
Echo一步法NGS文库Pooling
Echo可关联输入文件,软件自动完成高通量pooling
左:将需要pooling的各文库信息写入输入文件,采用Echo一步法完成Pooling?nbsp;
右:比较384个文库的200 nL/文库等体积Echo混样和等摩尔量Echo混样、br/> 结果显示经Echo pooling后文库获得更加均一的测序量、/span>
Echo 微量化NGS文库定量质控
Echo可完?84孔甚?536孔每板的超高通量微量化文库质控定量。声波移液含DNA染料的缓冲溶液、文库到酶标板中进行荧光检测。或是进行文库qPCR检测体系构建,避免标准品梯度稀释的累积误差和气溶胶污染。文库定量的微量化能够减少试剂消耗,有效控制成本。此外,Echo支持在软件中以表单的形式挑选某些文库做qPCR。整个实验过程数据可循,避免手工操作的窜孔等错误、/span>
采用Echo完成文库定量,微量化反应体系? uL? uL? uL绘制校准曲线
参考:
1.LABCYTE®: Brochure | Echo Acoustic Liquid Handling for Genomics Research, Version 1.0 | AUGUST 2017